Las enfermedades transmitidas por vectores constituyen un problema importante de salud pública y reemergente en América Latina. En ecosistemas de gran biodiversidad, como la cuenca del Amazonas, los patógenos transmitidos por vectores, como los arbovirus y hemoparásitos, mantienen una gran variedad de ciclos zoonóticos que involucran una gran amplitud de vectores artrópodos y reservorios de animales silvestres. A pesar de su importancia para la salud pública, aún no se han desarrollado herramientas sensibles de diagnóstico que permitan la vigilancia y el diagnóstico de patógenos zoonóticos en la fauna silvestre amazónica, debido principalmente a limitantes logísticas y financieras, así como al reto que supone la accesibilidad a ecosistemas remotos y complejos donde viven múltiples hospedadores. Este proyecto propone un sistema de monitoreo de enfermedades transmitidas por vectores en regiones tropicales basado en el desarrollo de un enfoque innovador de diagnóstico de secuenciación de próxima generación y una estrategia de colecta de muestras biológicas de fauna silvestre de bajo costo. Objetivos específicos 1) estandarización y validación de una nueva prueba diagnóstica basada en PacBio en fauna silvestre de la Amazonía, 2) análisis de riesgo de transmisión de patógenos en reservorios de animales silvestres, vectores y población humana susceptible, y 3) caracterización de la epidemiología y del monitoreo de patógenos circulantes en la cuenca amazónica mediante la evaluación de muestras de sangre colectadas en papel de filtro FTA, que ha demostrado ser un método rentable para la vigilancia en regiones tropicales remotas. Este proyecto pretende diseña un sistema de monitoreo adecuado y de bajo costo adaptado a las difíciles y aisladas condiciones de estos remotos escenarios amazónicos y reducirá la necesidad de cadena de frío durante el almacenamiento y transporte en escenarios tropicales que permita realizar investigaciones y vigilancia de enfermedades emergentes. Se validará una plataforma de diagnóstico novedosa enfocada en una amplia gama de patógenos infecciosos y se elaborará un marco epidemiológico que incluya las interfaces de fauna silvestre, vectores y humanos una la misma área desde un punto de vista sincrónico y diacrónico.